最初に一度だけ必要な最低限必要な初期設定（使用でいるメモリーの最大値の設定）と終了の仕方の説明です。

入力データの形式、IPAで用意されているサンプルデータを利用する方法についての説明です。

遺伝子名（Gene Symbol） にはSEPT7等、日付に似た名前があります。遺伝子名が入ったデータをエクセルに変換するときには注意が必要です。

IPAにデータをアップロードする際、Excel形式でもアップロードできますが、ネットワークの負荷を減らすためタブ区切りのテキスト形式にしてアップロードするとアップロードの時間...

IPAの主要な解析のセットであるコアー解析の設定、実行についての説明です。

"コアー解析実行結果のまとめ（Summary）についての説明です。 "

既知のどのようなパスウエイの活性化、不活化にアップロードしたデータが寄与しているか等既知のバスウエイと自分のデータとの関連が調べられます。またActivity Plot...

コアー解析の中でも使用される頻度の高い上流制御因子の解析です。

上流因子の更に上流の、マスター制御因子となっているかもしれない因子の解析（Causal networks）です。

下流解析（疾患、機能の解析）です。最初に下流の影響が四角形のヒートマップで表示されます。

上流と下流を矛盾が少ないように繋いだネットワーク Regulator Effects です。薬剤の新たな疾患の治療薬候補が見つかるかもしれません。

IPAには公開されている約110,000の差解析を行った実験のコアー解析の結果があります。Analysis Match により自分の実験結果と類似した実験を探索することができます。